Pulau ini sempat diduduki oleh pasukan Jepang pada masa Perang Dunia II. Sejak tahun 1942 tepatnya pada April, pulau ini juga dijadikan sebagai pangkalan militer. Namun, pada tahun 1944 bulan Mei pihak dari Amerika Serikat datang mengambil alih pulau ini. Lalu di tahun 2005 bulan September ditemukannya beberapa peninggalan tentara Jepang dan penduduk Papua pada pulau ini.
Pulau yang berada di bagian utara pantai papua ini telah lama tidak dihuni oleh manusia. Walaupun pulau ini tidak memiliki penghuni akan tetapi tidak membuat pulau Wakde kehilangan daya tariknya. Daya tarik dari pulau ini terdiri dari beberapa barang sisa peninggalan Perang Dunia II. Beberapa barang tersebut seperti besi kapal perang sampai landasan pesawat.
